农富康EM菌种渗入饲料和饮水进入动物肠道后，可以与肠道内有益菌结合，形成强有力的优势种群，抑制和消灭致病菌群，同时分泌与合成大量氨基酸、蛋白质、维生素、各种生化酶、抗生素、促生长因子等营养与激素类物质，以调整和提高畜禽机体各器官功能，提高饲料转化率，对畜禽产生免疫、营养、等多种作用，达到消除粪尿臭味、防病治病、提高成活率、促进生长和繁殖、降低成本、净化环境、提高经济等一系列明显效果。其具体作用表现为：

一、提高饲料转化率，降低养殖成本。
  经农富康EM菌种发酵或处理过的饲料，其大分子有机物（木质素、甲壳素等），被降解为小分子有机物（醣类、酯酸类等），加之菌体本身及其分泌（合成）的活性酶等物质均大大提高了饲料的营养价值，经测定，农富康EM菌种发酵饲料中所含18种氨基酸总量明显增加，不同饲料营养成份提高的幅度在10～28％之间，而且适口性好，畜禽喜食。饲喂农富康EM菌种饲料一般可使料肉比、料蛋比下降10％～20％；（用农富康EM菌种不仅可发酵秸秆作饲料，还可以发酵鸡粪喂猪、牛。猪可掺入25～40％，牛可掺入50％，均可大大节约粮食），农富康EM菌种投入低廉（1公斤可发酵500～1000斤饲料），将大大减少饲养成本。

二、促进生长，提高日增重，缩短饲养时间。

乳猪较常规饲养日增重增加40％以上，僵猪饲喂农富康EM菌种后可赶上（有的还可超过）正常猪的生长；蛋鸡提前（10天左右）产蛋，并延长产蛋高峰期两个月左右；肉用畜禽均可提前出栏。

三、用农富康EM菌种稀释饮水，能有效预防冬季猪棚鸡舍封闭太严而造成氨气中毒死亡等各种病症。

四、全面改善肉、蛋、奶的品质，生产鲜嫩无公害的纯正天然绿色食品。

   例如国家卫生部食品卫生监督检验所检测饲喂农富康EM菌种饲料户的鸡蛋，发现鸡蛋的蛋白质提高5.56％，而脂肪和胆固醇分别下降73.6％和82.2％，且蛋黄颜色较深，蛋白粘稠，没有检测出任何化学激素类残留。